1、黄芪白粉病：主要症状在叶正面、背面均产生白粉斑，像“毡状”；黄芪霜霉病，主要在叶背面生有白色到浅灰色霉层，颜色呈灰色、深灰色。这两种病害的防治可采用70％代森锰锌、50％甲基托布津、40％乙磷铝、15％三唑酮可湿性粉剂等农药进行喷雾防治，间隔7~10天连喷两次，有较好的防治效果。
2、黄芪根腐病：主要在根顶端发软、腐烂，与麻口病混合发生，这个病一旦发生较难防治，一般在进行种苗移栽时，剔除机械损伤根苗、病苗；其次进行土壤处理，用50％多菌灵可湿性粉剂拌土撒于栽植沟，或黄芪生长期进行灌根处理。