东台拥有最独特的辐射沙脊群和西太平洋最原始的滨海湿地，是生物多样性公约中重要的生物多样性区域，也是世界八大候鸟迁徙带的重要通道。近年来，东台市像保护眼睛一样保护生态环境，形成政府主导、全民参与、多边治理、合作共赢的机制。自然湿地保护率64%,居江苏省第一，720亩鸟类高潮位栖息地入选“生物多样性100+全球特别推荐案例”，条子泥岸段成为江苏省唯一的“中国美丽海湾”。
“十四五”期间，东台市将以更大力度推动地区的生物多样性保护，着力打造人与自然和谐共生的美丽东台。强化自然保护地监管，制定生物多样性保护规划和行动计划，建立权责明晰的工作格局和责任体系，实施卫星遥感监测和生态状况评估，开展自然保护地监督执法专项行动，提高生物多样性保护水平。完善监测网络建设，依托生物多样性本底调查数据，加快推进条子泥湿地等重点区域的生物多样性观测网络建设，为生物多样性保护工作提供决策依据。同时推进生态系统修复，积极推动生态岛建设试点，更大规模建设生态安全缓冲区。