什么因素会导致唇腭裂？唇腭发育和融合障碍的确切原因尚不完全清楚，可分为三个方面：遗传因素、胎儿发育环境因素和外部因素。
遗传因素：唇腭裂是一种多基因遗传疾病。CLP有病史的近亲和家庭孕妇，其儿童先天性异常的发生率高于正常人。
根据相关调查，父亲患唇腭裂后代的发病率为3%；母亲患唇腭裂后代的发病率高达14%。
胎儿发育环境因素：妊娠是一个极其复杂的过程，胎儿面部发育主要集中在妊娠第3-8周，腭部发育主要集中在妊娠第8-12周。CLP不同的因素会影响妊娠前后6个月的发生，因此，孕前6个月的母体营养指导是极其重要的。
大量的动物实验表明，怀孕前后，母亲缺乏各种营养物质可导致胎儿生长迟缓和先天性畸形，以及胎儿CLP与孕期维生素缺乏密切相关。