转基因作物大致分为耐除草剂（HT）、抗虫（Bt）或两者的组合。虽然还开发了其他性状，如抗病毒和抗真菌、抗旱、增强蛋白油或维生素含量，但耐除草剂和抗虫性状是美国作物生产中最常用的性状。耐除草剂的种子也广泛用于苜蓿、油菜和甜菜的生产，但大部分的转基因亩数都是种植在三大田间作物上：玉米、棉花和大豆。