总的来说，公积金贷款利率低、限制多、手续慢、额度低；商业贷款利率高、限制少、手续快、额度高。
首先看一张表，以贷款总额为120万（北京的公积金贷款最高额度）、贷款期限30年为例，对比等额本息还款的商业贷款、等额本金还款的商业贷款、公积金贷款的主要差别。最明显能看到的是，公积金贷款的月供只要5222元，比商业贷款（等额本息）的低了1000多元，月供压力小，并且总利息支出也少了好几十万。2下面详细讲述公积金贷款和商业贷款的差别：区别一、面对的房屋类型不同
住房公积金贷款只能用于购买70年产权的住宅时使用，除此之外的商住等类型的房屋是不能申请公积金贷款的；
公积金贷款是不以盈利为目的的政策性贷款，利率相对较低。而商业银行贷款是以赢利为目的，利率高一些。
公积金贷款额度上限，每个城市的上限额度不太一样，比如北京是120万。商业贷款没有明确上限，但是总的贷款额度受限于能开出证明的家庭总收入，通常要求家庭月收入为每月还款额的2倍。可以用这个房贷计算器计算一下，自己的贷款总额和相应的月供金额。
购买首套住宅最高可贷8成，最高120万；首套房若为商贷无论是否还清，二套房的公积金贷款最高可贷8成，最高80万。若首套为公积金贷款且未还清则不允许再次公积金贷款。
首套普通住宅最高可贷6.5成，首套非普通住宅最高可贷6成；二套普通住宅最高可贷5成，二套非普通住宅最高可贷3成。