医师多点执业注册与多职业机构备案都是指有执业资格的医师在两个以上的医疗机构进行医疗活动的行为，他们的区别在于是否在同一行政区划内，例如北京市东城区和西城区，如果都是在东城区内，就适用于多职业机构备案，如果同时在东城区和西城区执业，就是多点执业注册，如果是不同的城市或不同的省份，也是多点执业的范畴。
多机构备案指的是已经注册的执业医师需要在同一省级行政区划内，或执业助理医师需要在同一县级行政区划内的其他医疗机构工作的，可以申请多机构备案，且执业机构数量不受限制。