计算机安全措施主要包括三个方面：保护网络安全、保护应用服务安全和保护系统安全。各方面都要考虑物理安全、防火墙、信息安全、Web安全、媒体安全等等。
1.保护网络安全。网络安全是保护业务方网络系统之间通信过程的安全。确保机密性、完整性、认证和访问控制是网络安全的重要因素。
2.保护应用程序安全。应用安全主要是为特定应用建立的安全保护措施，它独立于网络的任何其他安全保护措施。虽然有些保护措施可能是网络安全服务的替代或重叠，比如应用层的Web浏览器和Web服务器对网络支付和结算信息包的加密，都是IP层加密，但是很多应用还是有自己特定的安全需求。
3.保护系统安全。系统安全防护是指从整个电子商务系统或网络支付系统的角度进行安全防护，与网络系统硬件平台、操作系统、各种应用软件等相互关联。