事发海域常有船只从土耳其向希腊、意大利等欧盟国家非法运送移民。希腊海岸警卫队说，他们时常在爱琴海检查可疑船只。希腊和土耳其同为北大西洋公约组织成员国，但两国在领土、移民等一系列问题上长期存在分歧。
土耳其官方媒体28日指认希腊使用防空导弹系统锁定土耳其战机的做法是“敌对行为”。希腊方面则予以否认。土耳其阿纳多卢通讯社28日报道，希腊部署在克里特岛的S-300防空导弹系统23日锁定了土耳其多架F-16战机，战机当时在希腊罗得岛以西空域飞行，飞行高度约3000米。
希腊行为“不符合联盟精神”，按照北约的相关规则，这算得上是“敌对行为”。不过，受干扰的土耳其战机“完成既定任务并安全返航”。
希腊战机当时在地中海东部锁定土耳其战机。土耳其“给予必要回应”并迫使希腊战机离开。
希腊国防部则说，5架土耳其战机在事先没有通知情况下伴飞美国B-52轰炸机。4架希腊战机紧急起飞驱逐土方战机。希腊已向北约和美国通报。